Το σημαντικότερο κριτήριο για την επιλογή του κέντρου εξωσωματικής γονιμοποίησης είναι η εμπιστοσύνη που εμπνέουν οι γιατροί και οι συνεργάτες του. Η σχέση με το θεράποντα ιατρό είναι ιδιαίτερη και για το λόγο αυτό πρέπει να εμπνέει ασφάλεια. Επίσης η εικόνα από τη λειτουργία του κέντρου, η άνεση και η τήρηση των κανόνων υγιεινής είναι εξίσου σημαντικά. Η φιλική συμπεριφορά του προσωπικού, σε συνδυασμό με την ακρίβεια και τη σωστή αντιμετώπιση κάθε προβλήματος ή απορίας που έχει το ζευγάρι είναι ενδεικτικά της επαγγελματικότητας του κέντρου. Η αποτελεσματικότητα που μεταφράζεται σε ποσοστά επιτυχίας και ο αριθμό των κύκλων ανά έτος, καθώς και το κόστος της θεραπείας είναι καθοριστικά για την επιλογή του καλύτερου κέντρου εξωσωματικής.
