Κατά το στάδιο της ωοληψίας, η γυναίκα προσέρχεται στη μονάδα σε συγκεκριμένη ώρα, νηστική. Η λήψη των ωαρίων είναι απλή επέμβαση ρουτίνας κατά την οποία τα ωάρια λαμβάνονται διακολπικά υπό άμεσο υπερηχογραφικό έλεγχο. Πραγματοποιείται παρουσία αναισθησιολόγου ο οποίος χορηγεί ήπια αναλγησία ώστε η όλη διαδικασία να είναι ανώδυνη για τη γυναίκα. Γίνεται παρακέντηση όλων των ωοθυλακίων που παρατηρούνται υπερηχογραφικά και το ωοθυλακικό υγρό παραλαμβάνουν οι εμβρυολόγοι για την αναζήτηση και εκτίμηση των ωαρίων. Το στάδιο αυτό διαρκεί περίπου 10-20 λεπτά. Η γυναίκα μεταφέρεται σε ειδικά διαμορφωμένο δωμάτιο για να ανανήψει. Το ζευγάρι μετά από 1 περίπου ώρα είναι έτοιμο να φύγει.
